イネ縞葉枯病抵抗性品種では、薬剤散布による媒介虫防除を実施しなくてもイネ縞葉枯病の被害はほとんど発生しない。そのため、本病の常発地域では非常に有効な防除対策である。本病に対する薬剤を削減できる利点を活かして減農薬化に向けた取り組みにも活用しやすい。地域における発病株数が減少することから、媒介虫のウイルス保毒虫率の低下が進み、本病のより早い鎮静化にもつながる。

一方で、抵抗性品種の栽培にともないヒメトビウンカの防除を止めてしまうと、ヒメトビウンカが多発して周辺の感受性品種における被害が拡大するリスクがある。また、ヒメトビウンカが媒介するイネ黒すじ萎縮病の発生が見られるようになったケースもある。このような理由から、抵抗性品種を栽培する水田においてもヒメトビウンカの薬剤防除を地域ぐるみで実施するケースも少なくない。

ヒメトビウンカの密度低減を目的として抵抗性品種利用時に薬剤の併用を行う場合は、生産者単位での小さな取り組みでは効果は小さく、地区単位で大規模に取り組むことが重要である。