Pedigree Finder

「Pedigree Finder」の概要 系譜情報データベース「Pedigree Finder」は、品種育成の加速化・交配プロセスの高度化を目的として、国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構が開発・運用するグラフデータベースです。
機械的なデータ検索・取得に対応するためにAPIを実装しています。
本データベースは試験運用を終え、2023年1月26日より、国内向けに本格運用を開始いたしました。

• 品種・系統一覧表は、一部作物についてアクセス制限をおこなっております。
• コシヒカリの系譜情報はデータサイズが大きいため描画に時間がかかってしまいます。また、初期画面では全体を表示させるためにかなり小さな系譜情報になってしまいます。系譜図を拡大してご覧いただければ幸いです。

Google Chrome 最新版でのご利用を推奨しています。 ご利用される端末の設定や、一部のブラウザでは、意図しない表示や正常に動作しない場合があります。

2023/03/07

• 【サービス一時停止のお知らせ】Pedigree Finder、NARO TogoDBのシステムメンテナンス　
  

3/14（火） 9:00 〜 16:00　
システムメンテナンスに伴い、Pedigree Finder、NARO TogoDBのサービスの停止が発生いたします。
ご不便をお掛けしますが、何卒ご了承いただきますようお願い申し上げます。

2023/03/01

• 自殖の場合に2本のエッジが重なってしまう現象を改善しました
  

コムギ Ardito(アオバコムギの親品種)の表示例
(↑クリックするとPedigree Finderで系譜図が表示されます)

2023/01/26

• 農研機構プレスリリース：ウェブで使える作物家系図の作成ツール 「Pedigree Finder」の開発
  

「Pedigree Finder」に関して、プレスリリースを行いました。

2023/01/16

• Plant & Animal Genome Conference: PAG 30 にて、「Pedigree Finder」についてポスター発表いたしました。
  

【Poster Title】
Pedigree Finder: A Web-based Viewer for Knowledge Graphs of Crop Pedigrees.

2022/12/01

• 品種・系統名の別名表示に対応いたしました
  

たとえば、イチゴの「久留米52号」を検索した場合、「久留米52号（さちのか）」として、「久留米52号」の登録品種名「さちのか」も合わせて表示させています。
系譜図の品種・系統名にカーソルを合わせると、別名（地方番号・旧系統名・商標など）が表示されます。

2022/11/30

• 第45回日本分子生物学会にて「Pedigree Finder」について発表いたしました。
  

【サイエンスピッチ】1SP-20-18 【ポスター番号】1P-042
【演題名】作物の家系情報グラフデータベース「Pedigree Finder」の構築とグラフを活用した形質予測
Pedigree Finder: A web-based crop pedigree viewer for graph databases and the development of a knowledge-graph-based trait prediction method

2022/11/28

• サツマイモ（カンショ） ゲストユーザー用データの整備：サツマイモ（カンショ）の系譜情報をゲストユーザーとしてお使いいただける機能を整備しました。
• 例）ベニアズマ の家系情報へのアクセス
• 例）コナセンガンの家系情報へのアクセス

2022/11/18

• アズキ ゲストユーザー用データの整備：アズキの系譜情報をゲストユーザーとしてお使いいただける機能を整備しました。
• 例）エリモショウズの家系情報へのアクセス
• 例）ちはやひめの家系情報へのアクセス　アズキ落葉病抵抗性で色付け

2022/11/08

• イチゴ ゲストユーザー用データの整備：イチゴの系譜情報をゲストユーザーとしてお使いいただける機能を整備しました。
• 例）福岡S6号（あまおう）の家系情報へのアクセス
• 例）さちのかの家系情報へのアクセス