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| manual [2024/03/28 (Thu) 14:28] – [2.2 形質・遺伝子情報で色付け・解除] kanegaeh976 | manual [2026/03/06 (Fri) 11:02] (現在) – [Web版 ユーザー登録手続きについて] kaneg**.*********@****.go.jp | ||
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| ====== Pedigree Finderの使い方 ====== | ====== Pedigree Finderの使い方 ====== | ||
| - | 説明動画を作成いたしました。[[https:// | + | ==== 説明動画 ==== |
| + | 説明動画を作成いたしました。[[https:// | ||
| - | ===== ユーザー登録手続きについて ===== | + | ==== 標準作業手順書(SOP)==== |
| + | [[https:// | ||
| + | |||
| + | ==== 論文 ==== | ||
| + | 鐘ケ江弘美・松下景・林武司・川島秀一・後藤明俊・竹﨑あかね ・矢野昌裕・菊井玄一郎・米丸淳一 (2022)\\ | ||
| + | 系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」. 育種学研究, | ||
| + | [[https:// | ||
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| + | ==== 参考・関連資料 ==== | ||
| + | プレスリリース[[https:// | ||
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| + | ===== Web版 | ||
| Pedigree Finder では**ユーザー登録不要な「ゲストユーザー」**として,__利用規約に同意の上__,イネやイチゴ,アズキなどの一部のデータを試すことができます。 \\ | Pedigree Finder では**ユーザー登録不要な「ゲストユーザー」**として,__利用規約に同意の上__,イネやイチゴ,アズキなどの一部のデータを試すことができます。 \\ | ||
| しかし、「ゲストユーザー」として利用できる作物の種類やデータ量は限られており、さらに多くのデータや作物にアクセスするためにはユーザー登録が必要となります。 \\ | しかし、「ゲストユーザー」として利用できる作物の種類やデータ量は限られており、さらに多くのデータや作物にアクセスするためにはユーザー登録が必要となります。 \\ | ||
| Pedigree Finderのユーザー登録には、利用を申請して許可される必要があります。 \\ | Pedigree Finderのユーザー登録には、利用を申請して許可される必要があります。 \\ | ||
| - | [[https:// | + | [[https:// |
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| + | ===== 配布版のご利用について ===== | ||
| + | 公設試や民間企業でクローズドデータをデータベースに格納し、Pedigree Finderを自社で管理・運用できるように、**育種データベースをコンテナ化(アプリケーションの実行環境をパッケージ化**)した配布版を開発いたしました。 | ||
| + | Pedigree Finderの配布版は[[https:// | ||
| + | 配布版はWindows/ | ||
| + | * **配布版をパソコン上で動かす**\\ | ||
| + | 導入コストは低いですが、それぞれのパソコンに個別にデータをアップロードする必要があるため、最新情報の共有が難しいという問題があります。\\ | ||
| + | * **配布版をサーバ上で動かす**\\ | ||
| + | サーバ構築やネットワークの設定費用が必要になりますが、最新情報を共有可能というメリットがあります。\\ | ||
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| 行 52: | 行 76: | ||
| 選択したデータセットと特性項目の組み合わせを取り消したい場合は、選択済みの組み合わせが表示されている一覧の削除アイコン(⑦)をクリックします。\\ | 選択したデータセットと特性項目の組み合わせを取り消したい場合は、選択済みの組み合わせが表示されている一覧の削除アイコン(⑦)をクリックします。\\ | ||
| 「形質・遺伝子情報で色付け」ボタン(⑧)を押すと、選択した形質で系譜図が色付けされます。\\ | 「形質・遺伝子情報で色付け」ボタン(⑧)を押すと、選択した形質で系譜図が色付けされます。\\ | ||
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| + | {{:形質選択20240328.png? | ||
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| + | データセットと特性項目の組み合わせを3つ選択した状態の例:\\ | ||
| + | {{: | ||
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| + | 3. 選択した形質が1種類の場合は凡例の位置、系統の外観ともに以下のように従来のスタイルで表示されます。\\ | ||
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| + | 4. 選択した形質が2〜4種類の場合は今回追加した複数表示版のスタイルで表示されます。\\ | ||
| + | {{: | ||
| ==== 2.3 系譜情報取得API ==== | ==== 2.3 系譜情報取得API ==== | ||
| URLから作物と品種を指定することで、系譜情報を取得することができます。Pedigree Finderに登録されており、且つ自身に閲覧権限がある作物のみ取得可能です。\\ | URLから作物と品種を指定することで、系譜情報を取得することができます。Pedigree Finderに登録されており、且つ自身に閲覧権限がある作物のみ取得可能です。\\ | ||
manual.1711603712.txt.gz · 最終更新: by kanegaeh976
