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--- manual [2023/05/30 (Tue) 09:48]
kanegaeh976 [2.5 系統メタデータリンク]
+++ manual [2024/12/20 (Fri) 17:07] (現在)
mukaiy [標準作業手順書（SOP）]
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 ====== Pedigree Finderの使い方 ======
-説明動画を作成いたしました。[[https://youtu.be/Dfau1eZL4lQ|こちら]]からご利用ください。
+==== 説明動画 ====
+説明動画を作成いたしました。[[https://youtu.be/Dfau1eZL4lQ|こちら]]からご利用ください。\\
-===== ユーザー登録手続きについて =====
+==== 標準作業手順書（SOP）====
+[[https://sop.naro.go.jp/document/detail/113|作物の系譜情報を利活用するためのデータベース(Pedigree Finder)標準作業手順書(サンプル版)]]
+==== 論文 ====
+鐘ケ江弘美・松下景・林武司・川島秀一・後藤明俊・竹﨑あかね ・矢野昌裕・菊井玄一郎・米丸淳一 (2022)\\
+系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」. 育種学研究, 24:115-123
+[[https://doi.org/10.1270/jsbbr.22J02]]
+==== 参考・関連資料 ====
+プレスリリース[[https://www.naro.go.jp/publicity_report/press/laboratory/rcait/156531.html|ウェブで使える作物家系図の作成ツール「Pedigree Finder」の開発]]
+===== Web版 ユーザー登録手続きについて =====
 Pedigree Finder では**ユーザー登録不要な「ゲストユーザー」**として，__利用規約に同意の上__，イネやイチゴ，アズキなどの一部のデータを試すことができます。　　\\
 しかし、「ゲストユーザー」として利用できる作物の種類やデータ量は限られており、さらに多くのデータや作物にアクセスするためにはユーザー登録が必要となります。　　\\
 Pedigree Finderのユーザー登録には、利用を申請して許可される必要があります。　　\\
 [[https://prd.form.naro.go.jp/form/pub/naro01/pedigree|Pedigree Finder 新規利用申請・所属変更申請]]から登録手続きを行ってください。
+===== 配布版のご利用について =====
+公設試や民間企業でクローズドデータをデータベースに格納し、Pedigree Finderを自社で管理・運用できるように、**育種データベースをコンテナ化（アプリケーションの実行環境をパッケージ化**）した配布版を開発いたしました。
+Pedigree Finderの配布版は[[https://www.naro.go.jp/inquiry/program.html|「職務作成プログラム利用に関するお問い合わせ」]]のページから利用申請が可能です。\\
+配布版はWindows/Mac/Linuxでも利用可能であり、Web版と同じ機能を整備しています。1)手元のパソコン上で動かす、2)サーバー上で動かすという2通りの使い方が出来ます。\\
+* **配布版をパソコン上で動かす**\\
+導入コストは低いですが、それぞれのパソコンに個別にデータをアップロードする必要があるため、最新情報の共有が難しいという問題があります。\\
+* **配布版をサーバ上で動かす**\\
+サーバ構築やネットワークの設定費用が必要になりますが、最新情報を共有可能というメリットがあります。\\
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 ==== 2.2  形質・遺伝子情報で色付け・解除 ====
-. データセットと特性項目を選択し、「形質・遺伝子情報で色付け」を押下します。図の例では、「ベンゾビシクロン感受性」を選択しています。\\
+. 系譜情報画面にて任意の系譜図を表示後、画面中部の「形質・遺伝子情報で色付け」ボタンの上部にあるプラスアイコンをクリックします。\\
-{{:Peta.png?600|}}\\
+{{:モミロマン20240328.png?800|}}\\
+. データセット（②）と特性項目（③）の組み合わせを選択するダイアログが開くので、任意の組み合わせを選択して、追加ボタン（④）をクリックします。\\
+追加ボタンをクリックすると系譜情報画面のデータセット、特性項目の一覧に追加されます。（⑥）\\
+最大4つまで追加できます。（5つ以上の追加、同じ組み合わせの複数回追加はできません）\\
+追加が終わったら、「閉じる」ボタン（⑤）でダイアログを閉じます。\\
+選択したデータセットと特性項目の組み合わせを取り消したい場合は、選択済みの組み合わせが表示されている一覧の削除アイコン（⑦）をクリックします。\\
+「形質・遺伝子情報で色付け」ボタン（⑧）を押すと、選択した形質で系譜図が色付けされます。\\
+{{:形質選択20240328.png?300|}}
-. 図のようにに表示されます。（色付けを解除したい場合は「色付け解除」を押下します）
+データセットと特性項目の組み合わせを3つ選択した状態の例：\\
+{{:データセットと特性項目選択20240328.png?400|}}
-{{:モミロマン20220328.png?600|}}
+. 選択した形質が1種類の場合は凡例の位置、系統の外観ともに以下のように従来のスタイルで表示されます。\\
+{{:モミロマン1形質20240328.png?600|}}
+. 選択した形質が2〜4種類の場合は今回追加した複数表示版のスタイルで表示されます。\\
+{{:モミロマン3形質20240328.png?800|}}
 ==== 2.3  系譜情報取得API ====
 URLから作物と品種を指定することで、系譜情報を取得することができます。Pedigree Finderに登録されており、且つ自身に閲覧権限がある作物のみ取得可能です。\\

Pedigree Finder

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